Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EgfrQ01279 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms