Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gja5Q01231 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gja5Q01231 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gja5Q01231 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gja5Q01231 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gja5Q01231 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gja5Q01231 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gja5Q01231 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gja5Q01231 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gja5Q01231 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gja5Q01231 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gja5Q01231 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gja5Q01231 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gja5Q01231 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gja5Q01231 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gja5Q01231 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja5Q01231 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gja5Q01231 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja5Q01231 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja5Q01231 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja5Q01231 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja5Q01231 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja5Q01231 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gja5Q01231 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gja5Q01231 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja5Q01231 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gja5Q01231 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gja5Q01231 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gja5Q01231 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gja5Q01231 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja5Q01231 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja5Q01231 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja5Q01231 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gja5Q01231 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gja5Q01231 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gja5Q01231 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gja5Q01231 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gja5Q01231 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gja5Q01231 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gja5Q01231 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gja5Q01231 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gja5Q01231 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gja5Q01231 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja5Q01231 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja5Q01231 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja5Q01231 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja5Q01231 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gja5Q01231 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja5Q01231 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja5Q01231 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja5Q01231 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gja5Q01231 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja5Q01231 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gja5Q01231 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja5Q01231 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja5Q01231 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gja5Q01231 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gja5Q01231 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gja5Q01231 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja5Q01231 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gja5Q01231 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gja5Q01231 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms