Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Grin2bQ01097 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms