Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde1bQ01065 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms