Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbp1Q00915 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms