Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms