Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax8Q00288 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax8Q00288 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax8Q00288 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax8Q00288 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax8Q00288 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax8Q00288 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax8Q00288 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax8Q00288 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pax8Q00288 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pax8Q00288 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pax8Q00288 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax8Q00288 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pax8Q00288 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax8Q00288 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax8Q00288 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax8Q00288 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pax8Q00288 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax8Q00288 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pax8Q00288 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax8Q00288 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pax8Q00288 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pax8Q00288 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax8Q00288 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax8Q00288 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax8Q00288 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax8Q00288 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax8Q00288 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax8Q00288 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax8Q00288 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax8Q00288 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax8Q00288 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pax8Q00288 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax8Q00288 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pax8Q00288 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax8Q00288 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax8Q00288 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax8Q00288 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax8Q00288 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax8Q00288 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax8Q00288 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax8Q00288 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax8Q00288 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax8Q00288 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax8Q00288 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax8Q00288 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax8Q00288 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax8Q00288 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms