Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp10Q000W5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms