Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms