Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc1P98083 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc1P98083 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc1P98083 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shc1P98083 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Shc1P98083 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc1P98083 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc1P98083 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shc1P98083 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shc1P98083 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc1P98083 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms