Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IhhP97812 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IhhP97812 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IhhP97812 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IhhP97812 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IhhP97812 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IhhP97812 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IhhP97812 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IhhP97812 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IhhP97812 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IhhP97812 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IhhP97812 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IhhP97812 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IhhP97812 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IhhP97812 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IhhP97812 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IhhP97812 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IhhP97812 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IhhP97812 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IhhP97812 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IhhP97812 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IhhP97812 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IhhP97812 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IhhP97812 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IhhP97812 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IhhP97812 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IhhP97812 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IhhP97812 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IhhP97812 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IhhP97812 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IhhP97812 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IhhP97812 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IhhP97812 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IhhP97812 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IhhP97812 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IhhP97812 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IhhP97812 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IhhP97812 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IhhP97812 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IhhP97812 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
IhhP97812 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IhhP97812 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IhhP97812 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IhhP97812 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IhhP97812 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IhhP97812 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IhhP97812 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IhhP97812 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IhhP97812 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IhhP97812 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IhhP97812 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IhhP97812 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IhhP97812 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IhhP97812 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IhhP97812 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IhhP97812 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IhhP97812 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IhhP97812 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IhhP97812 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IhhP97812 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IhhP97812 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IhhP97812 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IhhP97812 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IhhP97812 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IhhP97812 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IhhP97812 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IhhP97812 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IhhP97812 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IhhP97812 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IhhP97812 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IhhP97812 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IhhP97812 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IhhP97812 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IhhP97812 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IhhP97812 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IhhP97812 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IhhP97812 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IhhP97812 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IhhP97812 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IhhP97812 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IhhP97812 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IhhP97812 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IhhP97812 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IhhP97812 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IhhP97812 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IhhP97812 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IhhP97812 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IhhP97812 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IhhP97812 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IhhP97812 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IhhP97812 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IhhP97812 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IhhP97812 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IhhP97812 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IhhP97812 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IhhP97812 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IhhP97812 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IhhP97812 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IhhP97812 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IhhP97812 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms