Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AlkP97793 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AlkP97793 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AlkP97793 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AlkP97793 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AlkP97793 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
AlkP97793 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AlkP97793 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AlkP97793 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AlkP97793 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AlkP97793 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AlkP97793 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
AlkP97793 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AlkP97793 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AlkP97793 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AlkP97793 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AlkP97793 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AlkP97793 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
AlkP97793 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AlkP97793 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
AlkP97793 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AlkP97793 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AlkP97793 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AlkP97793 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AlkP97793 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AlkP97793 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AlkP97793 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AlkP97793 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AlkP97793 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AlkP97793 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AlkP97793 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AlkP97793 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AlkP97793 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AlkP97793 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
AlkP97793 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AlkP97793 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AlkP97793 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AlkP97793 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AlkP97793 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AlkP97793 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AlkP97793 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AlkP97793 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AlkP97793 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AlkP97793 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AlkP97793 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AlkP97793 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AlkP97793 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AlkP97793 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AlkP97793 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AlkP97793 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AlkP97793 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AlkP97793 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AlkP97793 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AlkP97793 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
AlkP97793 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AlkP97793 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AlkP97793 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AlkP97793 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AlkP97793 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AlkP97793 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
AlkP97793 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AlkP97793 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AlkP97793 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AlkP97793 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AlkP97793 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AlkP97793 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AlkP97793 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AlkP97793 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AlkP97793 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AlkP97793 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AlkP97793 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AlkP97793 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AlkP97793 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AlkP97793 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AlkP97793 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
AlkP97793 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AlkP97793 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AlkP97793 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AlkP97793 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
AlkP97793 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AlkP97793 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AlkP97793 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AlkP97793 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AlkP97793 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AlkP97793 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AlkP97793 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AlkP97793 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AlkP97793 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
AlkP97793 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
AlkP97793 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AlkP97793 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AlkP97793 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AlkP97793 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AlkP97793 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AlkP97793 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AlkP97793 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AlkP97793 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
AlkP97793 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AlkP97793 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AlkP97793 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms