Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcc1P97496 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms