Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms