Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms