Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smyd1P97443 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Smyd1P97443 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smyd1P97443 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smyd1P97443 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smyd1P97443 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smyd1P97443 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smyd1P97443 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smyd1P97443 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smyd1P97443 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smyd1P97443 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms