Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SmsP97355 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SmsP97355 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SmsP97355 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SmsP97355 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SmsP97355 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SmsP97355 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SmsP97355 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SmsP97355 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SmsP97355 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SmsP97355 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SmsP97355 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SmsP97355 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SmsP97355 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SmsP97355 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SmsP97355 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SmsP97355 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SmsP97355 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SmsP97355 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SmsP97355 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SmsP97355 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SmsP97355 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SmsP97355 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SmsP97355 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SmsP97355 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SmsP97355 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SmsP97355 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SmsP97355 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SmsP97355 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SmsP97355 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SmsP97355 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SmsP97355 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SmsP97355 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SmsP97355 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SmsP97355 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SmsP97355 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SmsP97355 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SmsP97355 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SmsP97355 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SmsP97355 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SmsP97355 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SmsP97355 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SmsP97355 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SmsP97355 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SmsP97355 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SmsP97355 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SmsP97355 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SmsP97355 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SmsP97355 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SmsP97355 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SmsP97355 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SmsP97355 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SmsP97355 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SmsP97355 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SmsP97355 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SmsP97355 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SmsP97355 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SmsP97355 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SmsP97355 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SmsP97355 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SmsP97355 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SmsP97355 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SmsP97355 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SmsP97355 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SmsP97355 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SmsP97355 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmsP97355 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SmsP97355 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmsP97355 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SmsP97355 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmsP97355 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmsP97355 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmsP97355 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmsP97355 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmsP97355 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmsP97355 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmsP97355 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmsP97355 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmsP97355 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SmsP97355 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SmsP97355 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SmsP97355 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SmsP97355 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SmsP97355 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SmsP97355 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SmsP97355 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SmsP97355 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SmsP97355 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SmsP97355 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SmsP97355 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SmsP97355 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SmsP97355 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SmsP97355 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SmsP97355 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SmsP97355 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SmsP97355 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SmsP97355 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SmsP97355 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SmsP97355 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SmsP97355 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms