Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhodP97348 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhodP97348 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhodP97348 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhodP97348 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhodP97348 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhodP97348 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhodP97348 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhodP97348 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhodP97348 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhodP97348 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhodP97348 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RhodP97348 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhodP97348 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhodP97348 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhodP97348 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhodP97348 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RhodP97348 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhodP97348 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhodP97348 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhodP97348 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhodP97348 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhodP97348 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhodP97348 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhodP97348 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhodP97348 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhodP97348 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhodP97348 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhodP97348 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhodP97348 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhodP97348 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhodP97348 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhodP97348 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhodP97348 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhodP97348 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhodP97348 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhodP97348 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhodP97348 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhodP97348 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhodP97348 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhodP97348 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhodP97348 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhodP97348 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhodP97348 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhodP97348 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhodP97348 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhodP97348 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhodP97348 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhodP97348 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhodP97348 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhodP97348 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhodP97348 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhodP97348 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhodP97348 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhodP97348 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhodP97348 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhodP97348 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhodP97348 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhodP97348 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhodP97348 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhodP97348 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhodP97348 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhodP97348 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RhodP97348 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhodP97348 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhodP97348 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhodP97348 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RhodP97348 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhodP97348 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhodP97348 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhodP97348 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhodP97348 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RhodP97348 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhodP97348 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhodP97348 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhodP97348 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhodP97348 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhodP97348 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhodP97348 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhodP97348 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhodP97348 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhodP97348 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhodP97348 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhodP97348 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhodP97348 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhodP97348 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhodP97348 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RhodP97348 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RhodP97348 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RhodP97348 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhodP97348 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RhodP97348 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RhodP97348 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhodP97348 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhodP97348 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhodP97348 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RhodP97348 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhodP97348 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhodP97348 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhodP97348 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms