Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trim43bP86448 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim43bP86448 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim43bP86448 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim43bP86448 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim43bP86448 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim43bP86448 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim43bP86448 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim43bP86448 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim43bP86448 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim43bP86448 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim43bP86448 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim43bP86448 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim43bP86448 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim43bP86448 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim43bP86448 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim43bP86448 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim43bP86448 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms