Protein–RNA interactions for Protein: P83510

Tnik, Traf2 and NCK-interacting protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnikP83510 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TnikP83510 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TnikP83510 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TnikP83510 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TnikP83510 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnikP83510 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnikP83510 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnikP83510 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnikP83510 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnikP83510 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnikP83510 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnikP83510 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnikP83510 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnikP83510 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnikP83510 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnikP83510 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnikP83510 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnikP83510 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnikP83510 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnikP83510 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnikP83510 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnikP83510 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnikP83510 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TnikP83510 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TnikP83510 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TnikP83510 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TnikP83510 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TnikP83510 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TnikP83510 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TnikP83510 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TnikP83510 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TnikP83510 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TnikP83510 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TnikP83510 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TnikP83510 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TnikP83510 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TnikP83510 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TnikP83510 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TnikP83510 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TnikP83510 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TnikP83510 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TnikP83510 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TnikP83510 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TnikP83510 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TnikP83510 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TnikP83510 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TnikP83510 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TnikP83510 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TnikP83510 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TnikP83510 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TnikP83510 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TnikP83510 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TnikP83510 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TnikP83510 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TnikP83510 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TnikP83510 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TnikP83510 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TnikP83510 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TnikP83510 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TnikP83510 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TnikP83510 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TnikP83510 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TnikP83510 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TnikP83510 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TnikP83510 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TnikP83510 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TnikP83510 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TnikP83510 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TnikP83510 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TnikP83510 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TnikP83510 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TnikP83510 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TnikP83510 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TnikP83510 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TnikP83510 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TnikP83510 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TnikP83510 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TnikP83510 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TnikP83510 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TnikP83510 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TnikP83510 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TnikP83510 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TnikP83510 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TnikP83510 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TnikP83510 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TnikP83510 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TnikP83510 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TnikP83510 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TnikP83510 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TnikP83510 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TnikP83510 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TnikP83510 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TnikP83510 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TnikP83510 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TnikP83510 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TnikP83510 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TnikP83510 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TnikP83510 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TnikP83510 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TnikP83510 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms