Protein–RNA interactions for Protein: P81269

Atf1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf1P81269 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf1P81269 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf1P81269 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf1P81269 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf1P81269 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf1P81269 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf1P81269 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf1P81269 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atf1P81269 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf1P81269 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf1P81269 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf1P81269 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf1P81269 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf1P81269 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf1P81269 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf1P81269 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf1P81269 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms