Protein–RNA interactions for Protein: P80316

Cct5, T-complex protein 1 subunit epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct5P80316 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cct5P80316 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cct5P80316 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cct5P80316 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cct5P80316 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cct5P80316 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cct5P80316 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cct5P80316 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cct5P80316 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cct5P80316 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms