Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otx1P80205 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx1P80205 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx1P80205 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx1P80205 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx1P80205 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx1P80205 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Otx1P80205 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms