Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufd1P70362 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms