Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plxna3P70208 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms