Protein–RNA interactions for Protein: P67871

Csnk2b, Casein kinase II subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2bP67871 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Csnk2bP67871 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk2bP67871 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms