Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3cP62823 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3cP62823 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3cP62823 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3cP62823 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3cP62823 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3cP62823 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rab3cP62823 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rab3cP62823 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rab3cP62823 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rab3cP62823 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rab3cP62823 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rab3cP62823 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3cP62823 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3cP62823 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rab3cP62823 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3cP62823 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3cP62823 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rab3cP62823 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3cP62823 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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