Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsm3P62311 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms