Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga11P61622 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga11P61622 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga11P61622 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga11P61622 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga11P61622 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga11P61622 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga11P61622 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga11P61622 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga11P61622 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga11P61622 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga11P61622 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itga11P61622 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itga11P61622 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga11P61622 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga11P61622 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga11P61622 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms