Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smg6P61406 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smg6P61406 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smg6P61406 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smg6P61406 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smg6P61406 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smg6P61406 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smg6P61406 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smg6P61406 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smg6P61406 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms