Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme3P61290 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme3P61290 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psme3P61290 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psme3P61290 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psme3P61290 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psme3P61290 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme3P61290 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms