Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abce1P61222 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abce1P61222 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abce1P61222 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Abce1P61222 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abce1P61222 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abce1P61222 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abce1P61222 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abce1P61222 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abce1P61222 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abce1P61222 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Abce1P61222 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abce1P61222 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abce1P61222 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abce1P61222 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abce1P61222 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abce1P61222 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abce1P61222 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abce1P61222 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abce1P61222 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abce1P61222 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abce1P61222 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abce1P61222 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Abce1P61222 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Abce1P61222 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Abce1P61222 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Abce1P61222 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Abce1P61222 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Abce1P61222 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Abce1P61222 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Abce1P61222 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abce1P61222 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abce1P61222 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abce1P61222 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Abce1P61222 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abce1P61222 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abce1P61222 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms