Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snap25P60879 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snap25P60879 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snap25P60879 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Snap25P60879 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap25P60879 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap25P60879 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap25P60879 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap25P60879 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap25P60879 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snap25P60879 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snap25P60879 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snap25P60879 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap25P60879 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap25P60879 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms