Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CirbpP60824 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CirbpP60824 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CirbpP60824 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CirbpP60824 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CirbpP60824 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CirbpP60824 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CirbpP60824 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CirbpP60824 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CirbpP60824 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CirbpP60824 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CirbpP60824 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CirbpP60824 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CirbpP60824 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CirbpP60824 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CirbpP60824 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CirbpP60824 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CirbpP60824 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CirbpP60824 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CirbpP60824 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CirbpP60824 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CirbpP60824 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CirbpP60824 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CirbpP60824 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CirbpP60824 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CirbpP60824 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CirbpP60824 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CirbpP60824 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CirbpP60824 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CirbpP60824 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CirbpP60824 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CirbpP60824 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CirbpP60824 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CirbpP60824 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CirbpP60824 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CirbpP60824 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CirbpP60824 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CirbpP60824 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms