Protein–RNA interactions for Protein: P60330

Espl1, Separin, mousemouse

Predictions only

Length 2,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Espl1P60330 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Espl1P60330 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Espl1P60330 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Espl1P60330 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Espl1P60330 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Espl1P60330 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Espl1P60330 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms