Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup43P59235 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup43P59235 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup43P59235 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup43P59235 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup43P59235 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup43P59235 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup43P59235 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup43P59235 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup43P59235 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup43P59235 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup43P59235 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup43P59235 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup43P59235 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup43P59235 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup43P59235 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup43P59235 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup43P59235 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup43P59235 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup43P59235 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup43P59235 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup43P59235 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup43P59235 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup43P59235 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup43P59235 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup43P59235 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup43P59235 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup43P59235 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup43P59235 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup43P59235 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup43P59235 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup43P59235 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup43P59235 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup43P59235 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup43P59235 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup43P59235 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup43P59235 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms