Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scarf2P59222 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms