Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Csrnp3P59055 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Csrnp3P59055 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms