Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rhbdl3P58873 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rhbdl3P58873 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms