Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm2P58774 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms