Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms