Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Snrpa1P57784 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snrpa1P57784 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms