Protein–RNA interactions for Protein: P57722

Pcbp3, Poly(rC)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp3P57722 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp3P57722 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp3P57722 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp3P57722 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp3P57722 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp3P57722 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp3P57722 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp3P57722 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp3P57722 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp3P57722 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp3P57722 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp3P57722 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp3P57722 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp3P57722 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp3P57722 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp3P57722 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp3P57722 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp3P57722 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp3P57722 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp3P57722 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp3P57722 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp3P57722 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp3P57722 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms