Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CckbrP56481 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CckbrP56481 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CckbrP56481 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CckbrP56481 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CckbrP56481 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CckbrP56481 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms