Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp5P56399 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp5P56399 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp5P56399 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp5P56399 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp5P56399 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp5P56399 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp5P56399 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms