Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GferP56213 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GferP56213 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GferP56213 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GferP56213 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GferP56213 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GferP56213 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GferP56213 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GferP56213 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GferP56213 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GferP56213 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GferP56213 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GferP56213 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GferP56213 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GferP56213 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GferP56213 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GferP56213 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GferP56213 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GferP56213 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GferP56213 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GferP56213 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GferP56213 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GferP56213 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GferP56213 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GferP56213 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GferP56213 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GferP56213 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GferP56213 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GferP56213 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GferP56213 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GferP56213 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GferP56213 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GferP56213 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GferP56213 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GferP56213 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GferP56213 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GferP56213 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GferP56213 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GferP56213 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GferP56213 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GferP56213 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GferP56213 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GferP56213 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GferP56213 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GferP56213 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GferP56213 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GferP56213 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GferP56213 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GferP56213 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GferP56213 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GferP56213 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GferP56213 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GferP56213 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GferP56213 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GferP56213 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GferP56213 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GferP56213 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GferP56213 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GferP56213 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GferP56213 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GferP56213 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GferP56213 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GferP56213 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GferP56213 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GferP56213 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GferP56213 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GferP56213 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GferP56213 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GferP56213 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GferP56213 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GferP56213 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GferP56213 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GferP56213 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GferP56213 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GferP56213 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GferP56213 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GferP56213 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GferP56213 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GferP56213 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GferP56213 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GferP56213 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GferP56213 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GferP56213 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GferP56213 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GferP56213 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GferP56213 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GferP56213 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GferP56213 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GferP56213 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GferP56213 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GferP56213 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GferP56213 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GferP56213 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GferP56213 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GferP56213 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GferP56213 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GferP56213 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GferP56213 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GferP56213 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GferP56213 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms