Protein–RNA interactions for Protein: P55258

Rab8a, Ras-related protein Rab-8A, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8aP55258 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab8aP55258 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab8aP55258 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab8aP55258 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab8aP55258 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab8aP55258 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab8aP55258 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab8aP55258 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab8aP55258 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab8aP55258 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab8aP55258 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab8aP55258 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab8aP55258 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab8aP55258 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab8aP55258 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab8aP55258 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab8aP55258 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab8aP55258 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab8aP55258 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab8aP55258 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab8aP55258 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab8aP55258 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab8aP55258 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab8aP55258 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab8aP55258 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab8aP55258 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab8aP55258 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab8aP55258 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms