Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pex2P55098 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pex2P55098 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pex2P55098 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pex2P55098 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pex2P55098 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pex2P55098 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pex2P55098 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pex2P55098 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pex2P55098 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pex2P55098 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pex2P55098 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pex2P55098 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms