Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms