Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc12a1P55014 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.3 ms